MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-6 DNA

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020827	T	6	6	690	695	0 %	100 %	0 %	0 %	472279763
2	NC_020827	CTT	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
3	NC_020827	T	7	7	785	791	0 %	100 %	0 %	0 %	472279763
4	NC_020827	TCA	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
5	NC_020827	CTAT	2	8	927	934	25 %	50 %	0 %	25 %	472279763
6	NC_020827	TAA	2	6	941	946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279763
7	NC_020827	TGC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279763
8	NC_020827	TA	3	6	1046	1051	50 %	50 %	0 %	0 %	472279763
9	NC_020827	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279763
10	NC_020827	TCT	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
11	NC_020827	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279763
12	NC_020827	CTT	2	6	1171	1176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279763
13	NC_020827	TACAT	2	10	1378	1387	40 %	40 %	0 %	20 %	472279764
14	NC_020827	T	7	7	1393	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	472279764
15	NC_020827	CTTT	2	8	1490	1497	0 %	75 %	0 %	25 %	472279764
16	NC_020827	ATTTG	2	10	1507	1516	20 %	60 %	20 %	0 %	472279764
17	NC_020827	AAT	2	6	1533	1538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
18	NC_020827	AAC	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279764
19	NC_020827	ATTGT	2	10	1594	1603	20 %	60 %	20 %	0 %	472279764
20	NC_020827	TAT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279764
21	NC_020827	AAT	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279764
22	NC_020827	ACT	2	6	1707	1712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279764
23	NC_020827	TCCC	2	8	1749	1756	0 %	25 %	0 %	75 %	472279765
24	NC_020827	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
25	NC_020827	CTA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
26	NC_020827	T	6	6	1851	1856	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
27	NC_020827	ATT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
28	NC_020827	CTA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
29	NC_020827	TGCC	2	8	2102	2109	0 %	25 %	25 %	50 %	472279765
30	NC_020827	AT	3	6	2195	2200	50 %	50 %	0 %	0 %	472279765
31	NC_020827	T	7	7	2240	2246	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
32	NC_020827	TTAAT	2	10	2252	2261	40 %	60 %	0 %	0 %	472279765
33	NC_020827	CCA	2	6	2309	2314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279765
34	NC_020827	T	6	6	2366	2371	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
35	NC_020827	TAA	2	6	2474	2479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
36	NC_020827	GTA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
37	NC_020827	TC	3	6	2492	2497	0 %	50 %	0 %	50 %	472279765
38	NC_020827	TTA	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
39	NC_020827	CTGT	2	8	2555	2562	0 %	50 %	25 %	25 %	472279765
40	NC_020827	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
41	NC_020827	TTC	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279765
42	NC_020827	CAA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
43	NC_020827	CGA	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279765
44	NC_020827	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
45	NC_020827	T	6	6	2922	2927	0 %	100 %	0 %	0 %	472279765
46	NC_020827	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279765
47	NC_020827	CAA	2	6	3017	3022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279765
48	NC_020827	AAT	2	6	3078	3083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
49	NC_020827	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279765
50	NC_020827	A	6	6	3135	3140	100 %	0 %	0 %	0 %	472279765
51	NC_020827	CAAA	2	8	3155	3162	75 %	0 %	0 %	25 %	472279765
52	NC_020827	GTAA	2	8	3234	3241	50 %	25 %	25 %	0 %	472279765
53	NC_020827	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279765
54	NC_020827	A	7	7	3342	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	472279765
55	NC_020827	AAT	2	6	3399	3404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
56	NC_020827	ATC	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279765
57	NC_020827	AGGATC	2	12	3561	3572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472279765
58	NC_020827	TAA	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279765
59	NC_020827	CGT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
60	NC_020827	TCTA	2	8	3636	3643	25 %	50 %	0 %	25 %	472279765
61	NC_020827	CTGA	2	8	3818	3825	25 %	25 %	25 %	25 %	472279765
62	NC_020827	GCT	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279765
63	NC_020827	T	7	7	4703	4709	0 %	100 %	0 %	0 %	472279766
64	NC_020827	CAA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279766
65	NC_020827	GAA	2	6	4757	4762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279766
66	NC_020827	TA	3	6	4772	4777	50 %	50 %	0 %	0 %	472279766
67	NC_020827	T	6	6	4893	4898	0 %	100 %	0 %	0 %	472279766
68	NC_020827	AGT	2	6	4931	4936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
69	NC_020827	CAC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279766
70	NC_020827	AAAAT	2	10	5002	5011	80 %	20 %	0 %	0 %	472279766
71	NC_020827	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279766
72	NC_020827	GT	3	6	5035	5040	0 %	50 %	50 %	0 %	472279766
73	NC_020827	TAAA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	472279766
74	NC_020827	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279766
75	NC_020827	ATT	2	6	5117	5122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
76	NC_020827	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279766
77	NC_020827	A	7	7	5179	5185	100 %	0 %	0 %	0 %	472279766
78	NC_020827	TAT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279766
79	NC_020827	ATGA	2	8	5592	5599	50 %	25 %	25 %	0 %	472279767
80	NC_020827	TGC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279767
81	NC_020827	TTA	2	6	5619	5624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
82	NC_020827	TTTTA	2	10	5663	5672	20 %	80 %	0 %	0 %	472279767
83	NC_020827	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279767
84	NC_020827	TTA	2	6	5930	5935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279767
85	NC_020827	AAAAT	2	10	5995	6004	80 %	20 %	0 %	0 %	472279767
86	NC_020827	A	6	6	6101	6106	100 %	0 %	0 %	0 %	472279767
87	NC_020827	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	472279768
88	NC_020827	AAT	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279768
89	NC_020827	TTGTTC	2	12	6923	6934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472279768
90	NC_020827	CTA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279768
91	NC_020827	TTG	2	6	7019	7024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279768
92	NC_020827	TTCAC	2	10	7059	7068	20 %	40 %	0 %	40 %	472279768
93	NC_020827	GTA	2	6	7084	7089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279768
94	NC_020827	TCG	2	6	7123	7128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
95	NC_020827	TTC	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
96	NC_020827	GTTT	2	8	7205	7212	0 %	75 %	25 %	0 %	472279769
97	NC_020827	CGT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
98	NC_020827	GCT	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
99	NC_020827	CAAC	2	8	7374	7381	50 %	0 %	0 %	50 %	472279769
100	NC_020827	GCT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
101	NC_020827	GTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279769
102	NC_020827	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279769
103	NC_020827	GAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
104	NC_020827	TATT	2	8	7598	7605	25 %	75 %	0 %	0 %	472279769
105	NC_020827	ATT	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
106	NC_020827	CA	3	6	7887	7892	50 %	0 %	0 %	50 %	472279769
107	NC_020827	CTG	2	6	7942	7947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279769
108	NC_020827	ACTTCA	2	12	7976	7987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279769
109	NC_020827	CTT	2	6	8013	8018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279769
110	NC_020827	CCGA	2	8	8163	8170	25 %	0 %	25 %	50 %	472279769
111	NC_020827	ATT	2	6	8213	8218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279769
112	NC_020827	TGA	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279769
113	NC_020827	ATTTG	2	10	8272	8281	20 %	60 %	20 %	0 %	472279769
114	NC_020827	GCC	2	6	8799	8804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279770
115	NC_020827	ACG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
116	NC_020827	CAAGC	2	10	8955	8964	40 %	0 %	20 %	40 %	472279770
117	NC_020827	ACC	2	6	8971	8976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279770
118	NC_020827	A	7	7	9004	9010	100 %	0 %	0 %	0 %	472279770
119	NC_020827	TTA	2	6	9060	9065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279770
120	NC_020827	CAAC	2	8	9079	9086	50 %	0 %	0 %	50 %	472279770
121	NC_020827	A	7	7	9109	9115	100 %	0 %	0 %	0 %	472279770
122	NC_020827	GAC	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279770
123	NC_020827	T	7	7	10338	10344	0 %	100 %	0 %	0 %	472279771
124	NC_020827	TAT	2	6	10362	10367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
125	NC_020827	CA	3	6	10424	10429	50 %	0 %	0 %	50 %	472279771
126	NC_020827	AT	3	6	10466	10471	50 %	50 %	0 %	0 %	472279771
127	NC_020827	ATC	2	6	10491	10496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
128	NC_020827	ACT	2	6	10528	10533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279771
129	NC_020827	TCTA	2	8	10542	10549	25 %	50 %	0 %	25 %	472279771
130	NC_020827	TTAT	2	8	10564	10571	25 %	75 %	0 %	0 %	472279771
131	NC_020827	TA	4	8	10592	10599	50 %	50 %	0 %	0 %	472279771
132	NC_020827	CTC	2	6	10628	10633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279771
133	NC_020827	T	6	6	10634	10639	0 %	100 %	0 %	0 %	472279771
134	NC_020827	TCG	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279771
135	NC_020827	TTA	2	6	10714	10719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279771
136	NC_020827	T	8	8	10777	10784	0 %	100 %	0 %	0 %	472279771
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.